注：本攻略以 PS4 版为例，Xbox One / PC 版可灵活参考
本作共有八个为支线任务，全部完成后会自动获得 举手之劳－完成所有支线任务 的奖杯。与奖杯有直接相关的支线任务有五个，含特殊收集品的支线任务有两个。
不速之客－库阿克雅库
完成“入侵物种”获得奖杯“不速之客”
心神合一 / 刀剑无情 / 越狱风云 / 传奇猛兽－秘密都市
“心神合一”：
完成“感性与理智”取回救星护符后获得奖杯
“刀剑无情”：
分为两部分。第一部分完成“死亡骰子”任务可开启隐藏商人，可购买强化小刀。
第二部分，完成“处决暂缓”任务之后获得精心制作的小刀，即可获得奖杯
“越狱风云”：
完成“处决暂缓”任务后获得奖杯
“传奇猛兽”：
在最终决战之前，在骷髅岛营地再次向哈库接受并完成“感性与理智”最后一部分的取回冠军神弓的委托
值得注意的是，击杀纳瓦人后不会立即跳杯，回到营地与哈库提交委托后才能获得奖杯
支线任务限定，影响100%收集
大部分支线任务及收集品都有地图和求生本能提示，大家按图索骥即可。这里给出不会被求生本能标出的，可能错过的收集品。
位于秘密都市的“寡妇之泪”委托有一个地方需要绕路才能到达：
最后有一项需要玩家自行寻找的线索且没有任何提示：
位于圣胡安传教所的“偏逢霉运”在墓地需要解决一个小孩谜题，一样没有求生本能提示。
